Dès que l'acheteur a accepté le prix de vente, il reçoit une facture et envoie son paiement. Celui-ci peut être réalisé par virement bancaire, Paypal, Skrill ou tout autre moyen de paiement courant pour ce type de transactions. Dès réception du paiement, le nom de domaine et le site sont transférés à l'acheteur. En pratique, le risque est inexistant pour l'acheteur, l'animateur de premiumdomains.fr ayant réalisé ces dix dernières années plusieurs milliers de transactions, avec un taux de satisfaction de 100 %. Toutefois, les grands comptes, les acheteurs recommandés ou ceux actifs sur les forums de discussion de webmasters peuvent demander à obtenir le site et le nom de de domaine avant l'envoi du paiement. Une autre solution est de passer par un tiers de confiance.
La transaction via Paypal vers un compte certifié, comme l'est celui de premiumdomains.fr, est suffisamment sécurisée, sachant que Paypal recrédite l’acheteur dans le cas où le vendeur ne délivrerait pas son site ou le nom de domaine. Pour des achats importants, il est toutefois courant d'utiliser un service de tiers de confiance comme ceux d'Escrow.com ou de Sedo. Dans ce cas de figure, l'acheteur verse la somme dûe au tiers de confiance, et celui-ci ne débloque celle-ci que lorsque la transaction a été finalisée.